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网页版nomogram制作? nit网页制作?

网页版nomogram制作? nit网页制作?原标题:网页版nomogram制作? nit网页制作?

导读:

教你用R画列线图(Nomogram),让预测模型结果可视化!1、验证列线图预测能力常用内部验证法(如Bootstrap自抽样法,使用C-统计量衡量准确性)、图形校准法(通过预...

教你用R画列线图(Nomogram),让预测模型结果可视化!

1、验证列线图预测能力常用内部验证法(如Bootstrap自抽样法,使用C-统计量衡量准确性)、图形校准法(通过预测生存概率与实际生存概率比较,得到预测校准曲线,理想情况下接近标准直线)和外部验证法(使用另一组数据验证模型预测效果)。

2、使用Cindex评估模型的预测精度。Cindex值越接近1,表示模型预测与实际结果的一致性越高。通过校准曲线直观地判断模型预测与实际结果的一致性,从而评估模型的预测能力。总结:Nomogram是一种将回归模型结果进行可视化的工具,适用于分类问题和生存分析问题。

3、制作列线图需确保足够研究对象建立有效模型,并在内部、外部验证模型预测能力,常用方法包括内部验证法(Bootstrap自抽样)、图形校准法和外部验证法。列线图绘制简便,R软件rms程序提供相应函数。

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4、诺莫图,中文常称为诺莫图或者列线图。它的目的是将Logistic回归或Cox回归的结果进行可视化呈现。它通过所有自变量回归系数的大小来制定评分标准,为每个自变量的每个取值水平分配一个评分。对于每位患者,可以计算出一个总分,然后通过得分与结局发生概率之间的转换函数计算出每位患者的结局时间发生的概率。

5、以R自带的泰坦尼克邮轮数据集titanic3为例,数据包含乘客的生还情况以及特征。目标利用年龄(age)、性别(sex)和客舱等级(pclass)预测乘客的生还概率。为了绘制列线图,首先需要总结数据分布,这有助于确定图的尺度。使用datadist函数可实现这一目标。然后,拟合预测模型并绘制列线图。

手把手教你用R画列线图(Nomogram)及解读结果

制作列线图需确保足够研究对象建立有效模型,并在内部、外部验证模型预测能力,常用方法包括内部验证法(Bootstrap自抽样)、图形校准法和外部验证法。列线图绘制简便,R软件rms程序包提供相应函数。

列线图的绘制使用R软件中的rms程序包,提供了相应的函数功能,简化了制作过程。结合列线图与相对风险指标(如OR、HR、RR等)的使用,可以使预测模型的结果更加直观、易于理解。患者可以根据自身因素水平快速查询到未来的生存概率,提高对健康状况的重视。

绘制列线图前,需要准备数据并按特定格式存储。数据应为连续型或已分组/离散化的变量,满足识别和绘制需求的格式。本文提供列线图绘制与结果解读步骤。示例中,逻辑回归模型用于拟合数据,得到变量间关系。通过调整年龄(age)、绝经状态(meno)和节点数(nodes),生成列线图并解释结果。

X轴表示诺莫图预测的概率。Y轴表示实际概率。绘制一条表示完美预测的绿色虚线。绘制红色虚线表示整个队列的预测与实际概率的关系。使用Bootstrapping方法进行偏差校正,绘制蓝色实线表示观察到的诺莫图性能。评估模型预测性能 使用Cindex评估模型的预测精度。

以R自带的泰坦尼克邮轮数据集titanic3为例,数据包含乘客的生还情况以及特征。目标是利用年龄(age)、性别(sex)和客舱等级(pclass)预测乘客的生还概率。为了绘制列线图,首先需要总结数据分布,这有助于确定图的尺度。使用datadist函数可实现这一目标。然后,拟合预测模型并绘制列线图。

参见图中红线)如何制作列线图 下面我们看看如何通过R语言来绘制列线图。 载入R包 我们打开Rstudio后,首先载入要用到的R包,如果没有安装的话,记得先安装。

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